Theo kết quả thanh tra của Bộ Tài nguyên và Môi trường, tính đến tháng 8 năm 2012, trên địa bàn tỉnh Đồng Tháp đã cấp 429 giấy phép về tài nguyên nước thuộc thẩm quyền của Ủy ban nhân dân tỉnh.
Trong đó, có 16 giấy phép hành nghề khoan nước dưới đất; 07 giấy phép thăm dò nước dưới đất; 334 giấy phép khai thác nước dưới đất; 47 giấy phép khai thác, sử dụng nước mặt; và 25 giấy phép xả nước thải vào nguồn nước.
Kết quả thanh tra cũng cho thấy, quy trình tiếp nhận, thẩm định và trình ký cấp phép đều đúng theo quy định của pháp luật hiện hành; đúng theo trình tự thủ tục hành chính theo cơ chế một cửa, một cửa liên thông đối với lĩnh vực tài nguyên và môi trường. Các hồ sơ được thẩm định và trình Ủy ban nhân dân tỉnh cấp phép đều đúng thời gian quy định.