Quy trình này quy định rõ trình tự tiếp nhận trả lởi góp ý, ý kiến đơn thư khiếu nại, tố cáo liên quan tới lĩnh vực quản lý tài nguyên nước.Bảo đảm đúng thẩm quyền của cục và quyền và lợi ích hợp pháp của các tổ chức, cá nhân.Quy trình này áp dụng đối với các hoạt động: Tiếp nhận và trả lời công văn, đơn thư của tổ chức, cá nhân; Tiếp nhận và trả lời ý kiến góp ý, tham gia với các bộ, ngành về nội dung liên quan đến chức năng, nhiệm vụ của cục; Tiếp nhận và trả lời đơn thư khiếu nại, tố cáo. Văn phòng cục cùng các đơn vị chức năng thuộc Cục chịu trách nhiệm áp dụng, thực hiện các nội dung liên quan tại quy trình này.