Quy trình này nhằm quy định thống nhất trình tự tổ chức thẩm định, góp ý kiến, hướng dẫn quy hoạch tài nguyên nước của tỉnh, thành phố trực thuộc Trung ương; quy hoạch ngành, lĩnh vực có khai thác, sử dụng tài nguyên nước do các Bộ, ngành địa phương xây dựng. Quy trình được áp dụng đối với hoạt động tổ chức thẩm định, góp ý kiến, hướng dẫn Quy hoạch tài nguyên nước của tỉnh, thành phố trực thuộc Trung ương; Quy hoạch ngành, lĩnh vực có khai thác, sử dụng tài nguyên nước do các Bộ, ngành địa phương xây dựng. Phòng Quản lý quy hoạch và điều tra cơ bản tài nguyên nước chủ trì,  phối hợp với các phòng, đơn vị liên quan giúp lãnh đạo Cục thực hiện quy trình này.