Quy trình này quy định thống nhất lộ trình xây dựng, phân bổ, điều chỉnh và bổ sung dự toán hàng năm:
- Hướng dẫn các bước lập dự toán thu, chi NSNN hàng năm theo quy định của Luật NSNN và các văn bản dưới luật khác của Chính phủ, Bộ Kế hoạch và Đầu tư, Bộ Tài chính và Bộ Tài nguyên và Môi trường phù hợp với thực tế tại đơn vị;
 - Xây dựng Dự toán thu chi NSNN dựa trên cơ cở đánh giá tình hình thực hiện thu, chi NSNN năm trước. Xây dựng theo đúng luật NSNN, phù hợp với biên chế lao động được giao và cơ chế quản lý tài chính đối với đơn vị theo qui định của Bộ Tài nguyên và Môi trường. Xây dựng dự toán hàng năm để đảm bảo đáp ứng các yêu cầu chi theo chế độ qui định, phù hợp với chủ trương định hướng của Nhà nước, và nhiệm vụ trọng tâm của ngành;
- Giao dự toán, điều chỉnh, bổ sung dự toán NSNN hàng năm cho các đơn vị dự toán cấp III trực thuộc, để chủ động sử dụng nguồn tài chính được giao. Quản lý, sử dụng nguồn tài chính, tài sản theo đúng các quy định hiện hành và qui chế quản lý của ngành, qui chế của đơn vị.

Quy trình này áp dụng đối với hoạt động xây dựng, phân bổ, điều chỉnh và bổ sung dự toán hàng năm tại Cục Quản lý tài nguyên nước. Phòng Tài chính phối hợp với các đơn vị  liên quan chịu trách nhiệm tham mưu cho Lãnh đạo Cục tổ chức thực hiện quy trình này.